FIDMAG es constitueix amb l'objectiu de promoure i impulsar la docència i la investigació en tots i cada un dels centres de les GHSCJ, sense perjudici que puguin beneficiar-se de les activitats desenvolupades per la Fundació Centres pertanyents o no a la congregació o persones no vinculades a la Institució.
Establir una col·laboració efectiva i integrativa entre ells, creant sinergies i desenvolupant tota la seva potencialitat.
Traslladar a la Societat els avenços de la investigació i contribuir a millorar la salut i la qualitat de vida de la població.
Esdevenir un referent nacional i internacional, amb publicacions en revistes d'alt nivell d'impacte, i estar presents en els principals organismes nacionals i internacionals.
Tenir estabilitat financera que asseguri una investigació de qualitat orientada a assolir resultats a curt, mitjà i llarg plaç.
