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Los cambios individuales a lo largo del tiempo en la cognición en pacientes con trastornos psicóticos se han estudiado muy poco, especialmente en el caso del primer episodio de psicosis (FEP). El objetivo fue establecer si el cambio en la cognición en las trayectorias individuales durante 2 años de una muestra de 159 pacientes FEP fue confiable y clínicamente significativo, utilizando el índice de cambio confiable (RCI) y los métodos de cambio clínicamente significativo (CSC). También estudiamos una muestra de 151 controles sanos emparejados. Los pacientes y los controles se evaluaron con un conjunto de pruebas neuropsicológicas, así como medidas premórbidas, clínicas y de funcionalidad. Analizamos el curso de las medidas cognitivas a lo largo del tiempo, utilizando el análisis de la varianza y las trayectorias individuales en las medidas cognitivas con la RCI basada en la regresión (RCISRB) y la CSC. El RCISRB mostró que entre el 5,4 y el 31,2% de los pacientes mostraron patrones de deterioro, y entre el 0,6 y el 8,8% mostraron patrones de mejora en estas pruebas a lo largo del tiempo. Los pacientes que mostraron mejores perfiles cognitivos según RCISRB (empeoramiento en cero a dos medidas cognitivas) mostraron mejores perfiles clínicos, premórbidos y funcionales que los pacientes que mostraron patrones de deterioro en más de tres pruebas. Al combinar los valores de RCISRB y CSC, encontramos que menos del 10% de los pacientes mostraron patrones de mejora o deterioro en la función ejecutiva y las medidas de atención. Estos resultados respaldan la opinión de que los deterioros cognitivos son estables durante los primeros 2 años de enfermedad, pero también que el análisis de las trayectorias individuales podría ayudar a identificar un subgrupo de pacientes con fenotipos particulares, que pueden requerir intervenciones específicas.