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Antecedentes: Se sabe poco sobre cómo se relacionan los cambios en las pruebas de neuroimagen funcional con las diferentes fases del trastorno bipolar. Objetivos: comparar la activación durante la realización de una tarea cognitiva en las diferentes fases de la enfermedad. Método: A los participantes con trastorno bipolar en manía (n = 38), depresión (n = 38) y eutimia (n = 38), así como controles sanos (n = 38), se les realizó una resonancia magnética funcional durante la realización de la tarea de memoria de trabajo n-back. Las activaciones y de-activaciones se compararon entre los subgrupos bipolares y los controles, y entre los subgrupos bipolares. También se introdujeron a todos los participantes en un modelo de efectos mixtos lineal. Resultados: En comparación con los controles, los subgrupos de manía y depresión, pero no el subgrupo eutimia, mostraron una menor activación en la corteza prefrontal dorsolateral, la corteza parietal y otras áreas. En comparación con el subgrupo eutimia, los subgrupos manía y depresión mostraron hipoactivación en la corteza parietal. Los tres subgrupos bipolares mostraron fracaso de de-activación en la corteza frontal ventromedial. El modelo de efectos mixtos lineal reveló un grupo adicional de reducción de la activación en la corteza prefrontal dorsolateral izquierda en los pacientes; ésta fue significativamente más marcada en la manía que en el subgrupo eutimia. Conclusiones: El trastorno bipolar se caracteriza por una hipoactivación dependiente del estado del humor en la corteza parietal. La reducción de la activación prefrontal dorsolateral es una característica adicional de la manía y la depresión, pero que puede mejorar parcialmente en la eutimia. El fallo en la de-activación en la corteza frontal medial muestra características de tipo rasgo.